神経回路を全部見る - potasiumchの日記

　ボスが出張から帰ってきた。出張先で聞いた話でもっともマッドサイエンティフィック*1だったのがこれということでメモ。

Toward a New Science of Connectomics
Sebastian Seung (MIT)

　全脳（あるいは組織）をスキャンし、３次元的に再構成して全細胞とその全結線（axonとdendrite）を同定してしまおうというプロジェクト。

　そのためにミクロトームのお化けみたいなのとベルトコンベヤーをくっつけて、スライスとスキャンまでを自動化するマシンを作成（これは既に出来ているらしい）。あとはナノメートル単位で得られた画像データから結線を再構成するべく画像処理をがんばります、ということらしい。

　Axonの最小幅が100nmぐらいというから、まあ10nmオーダー（10^-8m）の解像度でスキャンするとして、1cm(=10^-2m)オーダーの３次元データを扱うと、単純にピクセル数だけでも10^18個（8bits/pixelとして1EB（エクサバイト））。もちろんスキャンのずれとかいろいろ補正しながらだから・・・大変そうだ。

　でもこれが出来ると確かに有用そう。ヒトゲノムプロジェクトみたいに、神経科学における基本的なデータベースになるのかも。Two-photon imaging やったあとでこれにかけて、みたいなことが簡単に出来るようになれば、神経科学が進歩する速度は相当に上がりそう。2020年ぐらいまでには出来るかな？